※18年10月24日追記
5.6.1がリリースされ、本記事の動作は修正されました。
Linux環境でのアップデート及び新規インストールには、5.6.1をご使用下さい。
http://p5.archiware.com/release-notes

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Linux環境でP5 5.6.0の新規インストールやアップデート適用後、Webインターフェイスを使用する際にrootにてログインしているにも関わらずrootではないと表示され、各モジュールやライセンス登録などの操作ができなくなることがあります。

これはP5が参照しているユーザー情報に誤りがあるために発生します。
この問題はtelnetを使用して修正することができます。

telnetをインストールします。（下記はCentOSの場合のコマンドです）

   yum install telnet

インストールが完了したら、telnetでP5に接続します

   telnet localhost 9000

接続したらログインします。ログイン情報は下記になります。

   user : nsadmin

   passwd: x

ログインしたら、下記を入力して実行します。

   UserPref root trueName root

完了したら終了します。

   exit

これで、rootの情報でログインすると正常に操作できるようになります。